Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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