Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms