Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zzef1Q5SSH7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms