Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf12Q5SPL2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf12Q5SPL2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms