Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms