Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Skap2Q3UND0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms