Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms