Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms