Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec24aQ3U2P1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec24aQ3U2P1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms