Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kdm4dQ3U2K5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Kdm4dQ3U2K5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms