Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KhsrpQ3U0V1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms