Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms