Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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