Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ptchd1Q14B62 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ptchd1Q14B62 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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