Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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VgfQ0VGU4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VgfQ0VGU4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms