Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Spata18Q0P557 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Spata18Q0P557 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spata18Q0P557 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms