Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms