Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms