Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc7a1Q09143 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms