Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp2Q06649 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp2Q06649 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp2Q06649 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms