Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Thbs3Q05895 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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