Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1Q04750 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms