Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1bP70700 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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