Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms