Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps5P59438 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps5P59438 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms