Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NcstnP57716 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NcstnP57716 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcstnP57716 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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