Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp5P56399 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms