Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TspoP50637 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TspoP50637 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms