Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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