Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik2P39087 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms