Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprkP35822 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprkP35822 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprkP35822 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms