Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc5P32043 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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