Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RxraP28700 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxraP28700 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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