Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms