Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms