Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P10404 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms