Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ndufb1P0DN34 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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