Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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H2-Eb1P04230 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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H2-Eb1P04230 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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H2-Eb1P04230 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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