Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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P04212 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04212 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P04212 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms