Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01641 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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P01641 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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P01641 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01641 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01641 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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