Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops6O88545 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cops6O88545 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms