Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm10509O88255 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms