Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms