Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms