Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MttpO08601 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MttpO08601 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MttpO08601 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms