Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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