Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms