Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5225J3QPL3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5225J3QPL3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms