Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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