Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms